En el Hospital Garrahan se desarrollan las siguientes residencias:
Dependientes del Ministerio de Salud de la Nación
Clínica Pediátrica
Farmacia
Neurocirugía
Enfermería Pediátrica
Dependientes del Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Residencias Básicas (no requieren residencias previas)
Bioquímico Laboratorio Central
Bioquímico Lab. Inmunología
Cirugía Cardiovascular
Cirugía Infantil
Residencias Post Básicas (requieren residencia previa en Clínica Pediátrica)
Anatomía Patológica
Cardiología Infantil
Dermatología Pediátrica
Endocrinología Pediátrica
Gastroenterología Pediátrica
Hemato-Oncología Pediátrica
Infectología Pediátrica
Inmunología Pediátrica
Nefrología Pediátrica
Neonatología
Neurología Pediátrica
Nutrición Pediátrica
Reumatología Pediátrica
Neumonología Pediátrica
Terapia Intensiva